Na Fakultetu se kao znanstveno-nastavne i nastavne organizacijske jedinice ustrojavaju katedre. Broj, naziv, djelatnost i sastav katedri određuju se Odlukom Znanstveno-nastavnog vijeća. Katedrama rukovode pročelnici katedri. Pročelnik katedre organizira i rukovodi radom katedre, koordinira rad s drugim katedrama, surađuje sa srodnim katedrama drugih fakulteta ili visokoškolskih ustanova, predlaže plan rada i određuje program rada katedre, organizira i održava stručne sastanke, obavlja i druge poslove koje mu povjeri dekan ili znanstveno - nastavno vijeće. Za svoj rad je odgovoran dekanu i znanstveno-nastavnom vijeću ustrojbene jedinice
Na Fakultetu zdravstvenih studija Sveučilišta u Mostaru ustrojene su slijedeće katedre:
